它的主要優(yōu)勢：

　　1.可有助于放大低表達(dá)水平的靶蛋白信號；

　　2.由于能識別多個(gè)表位；

　　3.比單克隆抗體更能容許抗原中的微小變化；

　　4.會識別出與免疫原蛋白質(zhì)具有高同源性的蛋白質(zhì)，或者從非免疫原物種的組織樣品中篩選靶蛋白；

　　5.通常是檢測變性蛋白質(zhì)的首要之選；

　　6.多表位通常可提供更為有力的檢測。

　　不足之處為：

　　1.易于產(chǎn)生批次間差異；

　　2.產(chǎn)生大量非特異性抗體，有時(shí)可能在某些應(yīng)用中產(chǎn)生背景信號；

　　3.多表位使得檢測免疫原序列以確定是否有任何交叉反應(yīng)性非常重要；

　　4.不適用于探測抗原的特定結(jié)構(gòu)域，因?yàn)榭寡逋ǔ？勺R別多個(gè)結(jié)構(gòu)域。

　　相比之下，單克隆抗體雜交瘤制得后，就成為了恒定的再生源，所有批次都將相同；在切片和細(xì)胞染色造成的背景較低。具有特異性，適于分析測定中的一抗，或檢測組織中的抗原，并且通常所產(chǎn)生的背景染色顯著低。同質(zhì)性非常高；單克隆抗體的特異性能使其在混合物中和抗原高效地結(jié)合。

　　缺點(diǎn)是可產(chǎn)生大量特異性抗體，但是可能特異性過強(qiáng)。經(jīng)過抗原的化學(xué)處理后比多克隆抗體更易于丟失表位。這可通過使用同一抗原的兩個(gè)或多個(gè)單克隆抗體進(jìn)行補(bǔ)償。